Retos y consideraciones éticas

Los beneficios de la oncogenómica dependen de su implementación con calidad: pruebas validadas, rutas asistenciales claras, acceso a fármacos y gobernanza (ética y datos). Organismos globales impulsan programas que vinculan detección temprana, diagnóstico preciso y evidencia para escalar terapias costo-efectivas. Persisten brechas por recursos, disparidades étnicas (por sub-representación en paneles de referencia) y cobertura financiera. 

6) Retos y consideraciones éticas

Interpretación de variantes

VUS requieren prudencia; la reclasificación es dinámica y debe comunicarse.

Diferencias de frecuencia alélica por ancestría limitan la transferibilidad de scores poligénicos y la certeza en poblaciones sub-representadas. (Necesidad de bases de datos diversas.) (Instituto Nacional del Cáncer)

Biopsia líquida: limitaciones técnicas

Sensibilidad menor en enfermedad oligocelular/MRD.

Clonal hematopoyesis puede generar falsos positivos; se recomienda interpretación experta y, de ser necesario, emparejar con ADN leucocitario.

Importancia de estandarización (preanalítica, analítica y reporte). (De Gruyter Brill)

Consentimiento, privacidad y familia

Hallazgos germinales impactan parientes; se requiere consejería genética y planes de comunicación.

Consideraciones legales/aseguradoras varían por jurisdicción. (Instituto Nacional del Cáncer)

Equidad y acceso

Aun en sistemas públicos avanzados, la adopción de biopsia líquida y NGS depende de inversión, logística y evaluación costo-efectiva; experiencias recientes muestran aceleración de tiempos y potenciales ahorros, pero su escalado debe ser medido y contextual. (The Guardian)

7) Recomendaciones prácticas para equipos clínicos

A. Establecer algoritmos por tumor

• Definir paneles mínimos de biomarcadores obligatorios por entidad (p. ej., pulmón: EGFR, ALK, ROS1, BRAF, METex14, RET, NTRK; PD-L1, ±TMB según protocolo).
• Incorporar MSI/dMMR de rutina en múltiples tumores (colon, endometrio, gástrico, próstata, páncreas y otros) dada su relevancia terapéutica.
• En tumores con targets raros pero accionables (p. ej., NTRK), considerar paneles amplios. (nccn.org)

B. Integrar germinal y somático

• Usar las guías ASCO 2024 para selección de paneles germinales, con criterios explícitos de cuándo testear a un paciente y cómo interpretar el hallazgo somático que sugiere predisposición germinal.
• Formalizar rutas de derivación a genética clínica y cribado en cascada para familiares. (ASCO Publications)

C. Potenciar farmacogenómica

• Implementar DPYD pre-fluoropirimidinas con protocolos de dosis según CPIC; documentar el fenotipo (actividad DPD) en la historia clínica y automatizar alertas.
• Valorar UGT1A1 previo a irinotecán cuando el riesgo sea significativo (pauta de reducción inicial y escalado por neutropenia/tolerancia), alineando práctica con evidencia y recomendaciones regulatorias. (cpicpgx.org)

D. Estandarizar biopsia líquida

• Definir indicaciones claras: tejido insuficiente, urgencia terapéutica, monitoreo, detección de resistencia.
• Establecer controles de calidad y flujos de confirmación en tejido cuando sea necesario; minimizar artefactos por clonal hematopoyesis. (SciDirect)

E. Gobernanza y calidad

• Seleccionar laboratorios con acreditación y validación de paneles; reportes interpretables (clasificación de variantes, VAF, límites de detección).
• Medir tiempos puerta-a-resultado y su impacto en el inicio de tratamiento.
• Asegurar equidad: financiación/cobertura, mediación cultural y participación en estudios que aumenten la representación genética. (Organización Mundial de la Salud)